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calcul:cluster:exemples_batchs [2015/10/16 16:45] claude mercier |
calcul:cluster:exemples_batchs [2015/10/21 16:34] (current) claude mercier |
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- | Un script à envoyer sur le cluster va contenir les instructions sous la forme | + | **Un script à envoyer sur le cluster va contenir les instructions sous la forme \\ |
- | #SBATCH intructions | + | #SBATCH intructions\\ |
- | en debut de ligne du script (fichier.sh) | + | en debut de ligne du script (fichier.sh)** |
- | Ensuite on envoie le batch pour execution | + | **Ensuite on envoie le batch pour execution** |
- | cluster-head> sbatch fichier.sh | + | **cluster-head> sbatch fichier.sh** |
- | **exemple 1:** je veux 50 taches independantes, peu m'importe où elles vont s'exécuter | + | Quand le job est fini, ou s'execute, on peut voir la sortie dans le repertoire où on a lancé le job. |
+ | Un fichier slurm-NNN.out contient la sortie (NNN numéro du job) | ||
+ | |||
+ | **exemple 1:** je veux 50 taches indépendantes, peu m'importe où elles vont s'exécuter | ||
<code> | <code> | ||
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</code> | </code> | ||
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+ | **Exemple 4:** mes calculs doivent s'exécuter sur une machine avec coprocesseurs (K20 ou PHI) | ||
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+ | <code> | ||
+ | #!/bin/bash | ||
+ | |||
+ | ####### je voudrais phi ou gpu indifferemment | ||
+ | #SBATCH -p copro | ||
+ | |||
+ | ####### si on veut seulement gpu mettre -p K20 | ||
+ | ####### si on veut seulement xeon phi, mettre -p PHI | ||
+ | |||
+ | ####### mon code utilise une fois lancé 8 processeurs (multithreadé) | ||
+ | #SBATCH -n 8 | ||
+ | |||
+ | #SBATCH --job-name "test_copro" | ||
+ | |||
+ | echo "On tourne sur: $SLURM_NODELIST" | ||
+ | echo "nb procs: $SLURM_JOB_CPUS_PER_NODE" | ||
+ | |||
+ | ############slurm ajoute des variables qui cachent les coprocesseurs #####CUDA_VISIBLE_DEVICES=NoDevFiles | ||
+ | unset CUDA_VISIBLE_DEVICES | ||
+ | unset GPU_DEVICE_ORDINAL | ||
+ | |||
+ | cd ICL/CapsBasic | ||
+ | make clean | ||
+ | make | ||
+ | ./capsbasic | ||
+ | ./intelcaps | ||
+ | |||
+ | ./capsbasic NVIDIA | ||
+ | ./intelcaps NVIDIA | ||
+ | </code> | ||
+ | |||